OriginLab, ChromasPro, I-TASSER, Vector NTI, Geneious, MATLAB, MEGA, BioEdit, SerialCloner, ESPript, Pymol, DnaSP, Blas2go, PAUP, MAUVE, DNAstar. Así como varias herramientas de las bases de datos como NCBI, BRENDA, CAZy, EXPASY, Swiss-Prot, Galaxy, PDB, entre otras